Krājumu uzskaite

Preces, kas atrodas uzglabāšanas procedūrā muitas noliktavā, ir jāuzskaita, tiklīdz tās tiek ievestas muitas noliktavā. Uzskaite tiek nodrošināta, datus ar visām vajadzīgajām ziņām, kā arī tehniskos datus iekļaujot jebkādā informācijas nesējā, kas dod iespēju muitas iestādei uzraudzīt un kontrolēt procedūru, jo īpaši - preču plūsmu un statusa maiņu. Krājumu uzskaitē jāiekļauj visi dati, kas nepieciešami procedūras pareizai piemērošanai un pārraudzībai. Uzskaitē vienmēr jāatspoguļo tā brīža preču inventārs, kas joprojām pakļauts muitas noliktavas procedūrai. Uzskaites dokumentos ir jābūt ziņām par preču pagaidu izvešanu un par dažāda statusa preču kopīgu uzglabāšanu.

• A, C, D, E tipa muitas noliktavās par krājumu uzskaiti atbild muitas iestādes nozīmēts noliktavas pārzinis (noliktavas turētājs), 
• F tipa muitas noliktavās muitas uzskaiti veic apsaimniekojošais muitas punkts, 
• B tipa muitas noliktavās deklarācijas par nodošanu procedūrai pārzina uzraudzības muitas iestāde, 
• E tipa muitas noliktavās preces ņem uzskaitē, kad tās pienāk turētāja glabātavā.

Ja muitas noliktava darbojas arī kā pagaidu glabātava, preces ņem uzskaitē tad, kad tiek pieņemta deklarācija par procedūras piemērošanu.

Inventarizācija

Lai muitas noliktavā nodrošinātu pareizu saimniekošanu, pārraudzības muitas punkts kontroles vajadzībām var noteikt periodiski inventarizēt visas muitas noliktavas procedūrā nodotās preces.

Ministru kabineta 2006.gada 3.janvāra noteikumi Nr.16 "Muitas noliktavu darbības noteikumi"

Parastā apstrāde

Muitas noliktavā atļauts izmantot Regulas Nr.2454/1993 72.pielikumā minētos parastos preču apstrādes veidus. Parastā apstrāde paredzēta preču saglabāšanai, to izskata un tirdzniecības kvalitātes uzlabošanai. Metodi piemēro ārpuskopienas precēm, neizmainot preču kombinētās nomenklatūras astoņciparu kodu. Parasto preču apstrādes veidu piemērošana muitas noliktavā nedrīkst būt pārsvarā pār galveno veicamo muitas noliktavas darbību - preču uzglabāšanu saskaņā ar muitas procedūru - glabāšana muitas noliktavā.

Pagaidu izvešana no muitas noliktavas, nepārtraucot procedūru, un preču pārvešana no vienas muitas noliktavas uz citu, nepārtraucot procedūru

Lai veiktu Regulas Nr.2454/1993 72.pielikumā minētos parastos preču apstrādes veidus, preces ar uzraudzības muitas iestādes atļauju var no muitas noliktavas izvest uz laiku, nepārtraucot muitas procedūru, pēc 71.pielikuma parauga noformējot informācijas dokumentu INF 8 un tā kopiju. INF 8 izmanto, lai noteiktu elementus, kas vajadzīgi muitas parāda noteikšanai pirms parasto apstrādes veidu piemērošanas (izdod oriģināleksemplārā ar vienu kopiju). Pagaidu izvešanas termiņu var noteikt ne ilgāku par 3 mēnešiem, bet izvešanu var pagarināt.

Dažāda muitas statusa preču kopēja glabāšana

Ja Kopienas preces glabājas muitas noliktavas telpās vai glabātavās, ko izmanto precēm, kuras pakļautas muitas noliktavas procedūrai, tad šīm precēm jābūt identificējamām. A, C, D, E tipa muitas noliktavās, kuras Regulas Nr.800/997 40.panta nozīmē tiek definētas kā pārtikas krājumu noliktavas un kurās tiek novietotas Kopienas lauksaimniecības preces, par ko paredzētas kompensācijas izmaksas, telpas tiek nodalītas no muitas noliktavas telpām vai glabātavām, ko izmanto precēm, kuras pakļautas muitas noliktavas procedūrai.

Preces muitas noliktavā, nepiesakot muitas procedūru - ievešana muitas noliktavā:

Kopienas precēm
Muitas noliktavā tiek glabātas Kopienas lauksaimniecības politikai pakļautās preces, nepiemērojot muitas noliktavas procedūru, ja precēm jāpaliek muitas noliktavā saskaņā ar eksporta procedūru un saistībā kompensācijas izmaksām. Preces, kurām pieteikta izvešanas muitas procedūra, muitas kontrolē paliek līdz brīdim, kamēr tās izved no Kopienas teritorijas. Šajā laikā preces var atrasties muitas noliktavas telpās, nepiemērojot tām muitas noliktavas procedūru. Kopienas statusa preces, kurām kādā no Eiropas Savienības dalībvalstīm ir piemērota izvešanas procedūra EX1 vai EU1 un kuras tiek novietotas muitas noliktavā konsolidēšanai to tālākai izvešanai uz trešajām valstīm, muitas noliktavas procedūra saskaņā ar Regulas Nr.2913/92 106. panta 2.punktu netiek piemērota. 

Ārpuskopienas precēm
Ja Kopienas avotu (izejvielu, materiālu) izmantošanai trūkst ekonomiska pamata, var piemērot ievešanu pārstrādei, un, ja ārpuskopienas avotu izmantošana ļauj piemērot pārstrādi Kopienā, ārpuskopienas precēm var veikt pārstrādi muitas kontrolē. Gan ievešanu pārstrādei, gan pārstrādi muitas kontrolē veic ar uzraudzības muitas iestādes atļauju tās noteiktajā kārtībā. Darbības ar precēm, kas saistītas ar pārstrādi, nedrīkst būt pārsvarā pār galveno muitas noliktavā veicamo darbību - preču uzglabāšanu.